1989年7月，大量人骨在位于东京新宿的一处施工现场被发现，施工现场是原日本陆军军医学校所在地，侵华日军731部队大本营被认为就设在该校内。 日本民间人士于1990年成立了“调查军医学校旧址所发现人骨问题协会”，以推动调查真相。
近日，该协会和部分民众在陆军军医学校旧址及周边进行实地考察活动。他们认为，这些人骨可能与战争犯罪有关，并要求日本政府展开彻查。该协会认为，这些人骨在日本陆军军医学校旧址，也被认为是侵华日军731部队的大本营被发现，因此极有可能与731部队的人体实验有关。
“调查军医学校旧址所发现人骨问题协会”事务局长鸟居靖：正式公布的是62具人骨，但实际上数量更多。这里可以看到有刀伤痕迹；这里可以看出有伤口，像是头部遭受打击；这是枪伤痕迹，这个枪伤被鉴定是死后的枪伤，可能死后被做过子弹穿颅实验。为什么知道是死后的实验呢？前面是子弹射入口，后面的子弹射出口这么大，如果大脑不是死后干燥情况下，就不会出现这样的差异。这些照片都是人骨照片，这个照片很明显是被锯断的大腿骨，为什么被锯断呢？理由不知道。
2001年，日本厚生劳动省曾发布调查报告称，施工现场发现的人骨是标本，有证言否定人骨来自日本国外，厚生劳动省表示无法断定人骨与731部队存在关联。但“调查军医学校旧址所发现人骨问题协会”认为仅仅根据证言得到的判断不够严谨，日本政府应该继续进行更彻底的鉴定和调查，但政府却以各种理由搪塞拒绝。
“调查军医学校旧址所发现人骨问题协会”成员 吉田守：3月25日我们又去厚生劳动省，要求进行彻查，得到的回答依然是只要没有确定这些人骨与731部队有关，就不进行调查。但是我们认为，日本政府就这些人骨的来历展开彻查才是正确的态度。
日本民间团体和民众表示，二战时期日军犯下的罪行不应被掩盖，日本政府应该就发现的人骨进行科学鉴定与调查，让后代了解历史真相，不再重蹈战争覆辙。
当地居民 村田真由美：很多历史真相我们日本人都不知道。做学生的时候，关于战争、战争责任、真相等，对学校所教的内容都信以为真。但当我长大成人后，听到健在的战争亲历者证言才知道，学校里教的很多都不是事实。所以希望学校教给我们正确的历史，我希望能了解历史的真相。
“调查军医学校旧址所发现人骨问题协会”事务局长鸟居靖：不仅是人骨问题，日本政府对于战争时期的残暴行径基本都没有承认，特别是关于731部队。虽然承认731部队的存在，但对于731部队的非人行径从未承认。即使有这么多确凿的证据，但仍然声称没有资料，遮遮掩掩。我认为如果日本不承认战争时期的残暴行径，日中之间不可能建立真正的友好。我认为日本政府应该以正确的态度对待这段历史。
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